Los saltos condicionales permiten pasar de una etapa a otra sin ser éstas consecutivas, sin activar las etapas intermedias. Estos saltos pueden darse en sentido evolución del Grafcet como en sentido inverso a la evolución del Grafcet.
Para explicar con ecuaciones estos saltos condicionales utilizaremos el siguiente ejemplo:
En este ejemplo partimos de la etapa E1 y para activar justo a continuación la etapa E7, activaremos la condición de transición Fx y mantendremos desactivado la condición de transición F1.
Las ecuaciones que obtenemos con este ejemplo son las siguientes:
